(新世纪应用型高等教育)计算机辅助药物设计—基本方法原理概要与实践详解(化工类课程规划教材) 下载 pdf 百度网盘 epub 免费 2025 电子书 mobi 在线

　　本书系作者在近年来为同济大学本科生开设的“计算机辅助药物设计”课程所用讲义基础上，经扩展、补充和修改编写而成。

本书内容涵盖了“计算机辅助药物设计”七大研究方向———虚拟小分子生成、大分子结构预测、定量构效关系、药效团模型、分子对接、全新药物设计和动态模拟（分子动力学/*动力学/蒙特卡洛），并且第一次系统地对这些技术的操作进行了讲解。本书共有九章，第一章对“计算机辅助药物设计”和配合本书实例讲解的国际著名软件MOE的全貌进行了介绍;第二章到第八章依次对“计算机辅助药物设计”的七大研究方向进行了理论和实践操作的系统介绍;第九章对MOE中三个特色模块进行了单独介绍。另外，每章还设有一个“知识拓展”，该部分主要是介绍一些更为前沿或热门的知识，希望能为读者的相关研究或深入学习起到抛砖引玉的效果。

另外，为方便使用，凡本书中提及的输入文件、中间结果和最后结果等附件，读者均可到www.cadd-moe.org网站中按章节免费获取。

本书是国内第一本专门为本科生撰写的《计算机辅助药物设计》教材，此外，本书也将是工业界相关人员和研究生的一本非常合适的参考书。

第一章 “计算机辅助药物设计”与MOE概貌

　一、导言

　二、“计算机辅助药物设计”概貌

　三、MOE概貌

　四、知识拓展

　五、本章小结

　六、复习思考题

第二章 虚拟组合库设计

　一、虚拟组合库设计的运用

　二、组合化学与虚拟组合库设计

　三、虚拟组合库设计方法原理

　四、虚拟组合库设计的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第三章 生物大分子结构预测

　一、生物大分子结构预测的运用

　二、生物大分子结构测定与生物大分子结构预测

　三、生物大分子结构预测的方法原理

　四、同源模建的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第四章 定量构效关系

　一、定量构效关系的运用

　二、构效关系与定量构效关系

　三、定量构效关系的方法原理

　四、定量构效关系的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第五章 药效团模型

　一、药效团模型的运用

　二、活性特征基团和药效团

　三、药效团模型的方法原理

　四、药效团模型的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第六章 分子对接

　一、分子对接的运用

　二、分子（生化）水平的高通量筛选技术和分子对接

　三、分子对接的方法原理

　四、分子对接的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第七章 全新药物设计

　一、全新药物设计的运用

　二、片段组学（基于片段的药物设计）和全新药物设计

　三、全新药物设计的方法原理

　四、全新药物设计的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第八章 分子动力学、随机动力学和蒙特卡洛

　一、分子动力学、随机动力学和蒙特卡洛的运用

　二、体系全部性质测定和分子动力学/随机动力学/蒙特卡洛

　三、分子动力学、随机动力学和蒙特卡洛的方法原理

　四、分子动力学、随机动力学和蒙特卡洛的操作要领

　五、知识拓展

　六、本章小结

　七、复习思考题

第九章 MOE中其他实用模块

　一、蛋白 -配体相互作用指纹

　二、大分子质子化

　三、抗体同源模建

　四、知识拓展

　五、本章小结

　六、复习思考题

　参考文献

　　朱瑞新博士任教于同济大学生命科学与技术学院。其主要科研方向有：

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　　一、药物设计与合成

　　运用计算机辅助药物设计和有机合成基本原理和方法进行药物筛选、改良和全新设计研究。在投资商和生物学研究工作者等紧密合作伙伴的多年帮助下，朱瑞新博士已建有从化学到生物，从分子模拟到实验测试的完整药物研发团队。现主要开展如下三方面的工作：

　　1． XXX药的改良(保密)；

　　2． 路线复杂，处理繁琐的化合物合成相关程序优化（发展新的合成方法或路线）；

　　3． 客户需求的定制。

　　二、计算机辅助药物设计工具的整合与开发

　　致力于将化学信息学工具与生物信息学工具整合的研究，即药物设计分子模拟平台建设（将中药相关技术作为重心）。现主要开展如下三方面的工作：

　　1． 化合物的通用数据库平台建设（包括数据库内容和相关分析方法）；

　　2． 整合高通量数据（如芯片数据和测序数据），开发药物/化合物作用机理分析平台；

　　3． 客户需求的定制。

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编辑推荐

　　“计算机辅助药物设计”是门非常综合且前沿的学科，对于本科生而言系统的理论学习将会严重打击其学习的积极性;同样如果只是科普性的介绍一些新概念或者介绍一些传奇故事，而不进行系统的实践操作，那么学生们的动手能力无法得到很好的训练，这点对于部分本科毕业即将要走上工作岗位的同学显得尤为重要。因此本书对于理论部分的介绍尽量做到简明扼要，而对于实践操作的讲解尽量做到详细，以期能够让读者一直保持着“强烈的掌握欲望”快速掌握“计算机辅助药物设计”核心技术。